下一代基于鄰近連接的檢測如何推進空間蛋白質組學的

研究人員可以使用 Navinci 的基于鄰近連接的創新空間蛋白質組學解決方案組合來可視化和量化蛋白質、它們的相互作用以及細胞和組織中的修飾。

蛋白質形成巨大、復雜的相互作用網絡來介導細胞功能。它們的表達和結合是動態的，細胞響應內部和外部刺激而上調或下調蛋白質水平以及蛋白質復合物的組裝和分解。蛋白質功能可以通過翻譯后修飾 (PTM)、組織分布模式和亞細胞定位進一步完善。

蛋白質并不是孤立發揮作用的。大多數蛋白質功能是由蛋白質-蛋白質相互作用 (PPI) 和 PTM 介導的。蛋白質相互作用組的一個節點的破壞可能會破壞整個網絡的平衡。因此，闡明 PPI 是了解健康和疾病中的細胞信號傳導途徑以及識別新藥物靶點的關鍵。  

為了充分了解蛋白質功能的復雜性，有必要在其天然環境中觀察 PPI，然而，該領域的檢測工具歷來受到限制。使用免疫共沉淀、蛋白質印跡或 FRET/BRET 測定等技術無法獲得蛋白質動態的空間視圖，這些技術會破壞細胞和組織結構或天然蛋白質狀態。此外，使用傳統的免疫熒光 (IF) 和免疫組織化學 (IHC) 方法無法可靠地進行 PPI 研究，這些方法只能確定兩個熒光標簽是否出現共定位，這可能是分辨率限制的結果，而不是真正的結果。相互作用。

Naveni ®基于鄰近連接的檢測是下一代技術，可 通過檢測和可視化改進蛋白質及其修飾的原位研究：

• 蛋白質-蛋白質相互作用
  

• 同時游離和相互作用的蛋白質
  

• 翻譯后修飾（例如磷酸化）

• 蛋白質定位和分布

建立在遺產之上

開發原始鄰近連接分析 (PLA) 的先驅者也構建了 Navinci 的平臺。Navinci 的產品基于 Naveni ®鄰近連接技術，這是一種基于鄰近連接的方法，利用寡核苷酸設計和抗體-寡核苷酸綴合物的現代進步，在特異性、靈敏度、易用性和穩定性方面比現有空間蛋白質組學技術具有顯著優勢。數據解釋。

優異的特異性

Naveni ®鄰近連接技術使用一對精心挑選的 Navenibodies（與專有寡核苷酸臂綴合的抗體）來直接（即通過初級綴合物系統）或間接（即通過次級綴合物系統）檢測感興趣的靶標。僅當檢測到的蛋白質距離為 40 nm 或更小時，Navanibody 對之間才會發生鄰近連接，從而確保 PPI 檢測。通過 Navenibody 對對靶標進行雙重識別，通過減少抗體交叉反應性引起的非特異性結合來增強特異性。

高靈敏度

專有的 UnFold 檢測系統可放大信號，與現有選項相比，可以實現高靈敏度和更高的信噪比。當發生鄰近連接時，Navenibodies 上的寡核苷酸探針被激活并雜交以形成 DNA 環。添加聚合酶后，就會啟動滾環擴增 (RCA) 反應，從而擴增環序列。這增強了信號強度，因為每個重復序列都可以通過單獨的熒光團標記的檢測寡核苷酸進行檢測，從而導致數百個熒光標簽標記單個 PPI。

清晰的目標檢測和定量

這些信號可以作為不同的熒光或顯色點進行檢測，可以通過熒光或明場顯微鏡（取決于所選的試劑盒格式）進行可視化。使用數字圖像分析或視覺解釋可以輕松量化結果。

無需人工表達

由于 Naveni ®鄰近連接技術，研究人員有望實現比傳統 PLA 高達 10 倍的靈敏度提高，從而可以檢測內源水平的低豐度蛋白質或難以檢測的靶標，而無需實驗過度表達，并且只需極少的投入使用珍貴（且昂貴）的抗體。

與現有的組織學工作流程和設備兼容

所有 Navinci 產品均與現有的組織學工作流程和標準組織學設備兼容。可選擇明場顯微鏡和熒光顯微鏡，無需額外儀器。協議與核染料或組織學染色劑（如蘇木精和伊紅等）共染色兼容，可在保留的細胞或組織結構內提供目標 PPI 的可視化。